Tanınmış bir okul olan yatılı özel Cross Akademisi'nde gündüz ve gece dersleri bir arada bulunuyor. Gündüz derslerine sıradan öğrenciler devam ederken elit bir grup olan gececi öğrencilerin hepsi birer vampir!! Gündüzcüler için vampirlerin varlığı da gece derslerinin gerçek yüzü de kesinlikle bir sır. Bu büyük sırrı iki kişi korumakla görevli, Yuki ve Zero, onlar Akademinin Koruyucuları!! Gece sınıfının sınıf temsilcisi saf kan vampir olan Kaname ise bu önemli görevde Yuki ve Zeronun en büyük destekçisi. Zero E Düzeyine düşmenin verdiği acıyı çekerken, hiç beklenmedik bir zamanda Yuki'yi dudaklarından öper. Yuki ise geçmişini hatırlayamamaktan duyduğu rahatsızlık nedeniyle vampir avcılarının arşivinde geçmişiyle ilgili bir ipucu bulmaya çalışır. Akademi sömestr tatiline girer... Peki ya o karanlığın içinden çıkan şey de ne?